Ejecutar las políticas públicas relacionadas con el Sistema Nacional Integral Agroalimentario (SNIA), dictadas por el Ejecutivo Nacional, con objeto de garantizar la distribución justa y equitativa en materia de producción e importación de productos agroalimentarios en coordinación con los entes u órganos competentes, así como, asegurar la disponibilidad y acceso oportuno de alimentos inocuos, de calidad y cantidad suficiente a la población y al mercado nacional, contribuyendo con la seguridad y soberanía agroalimentaria del país.

Ser una institución de vanguardia, moderna y altamente calificada en materia de control, inspección y fiscalización del sector agroalimentario y sus actividades conexas, contribuyendo a consolidar la seguridad y soberanía alimentaria del país.